Le relazioni in campo scientifico tra Italia ed Estonia sono disciplinate dall’Accordo sulla Cooperazione culturale, scientifica e tecnologica firmato il 22 maggio 1997 a Tallinn ed in vigore dal 30 gennaio 2000. Questo prevede, tra le altre cose, la realizzazione di ben nove progetti di cooperazione scientifica tra Università ed Istituzioni italiane ed estoni nei settori della medicina, dell’economia, dell’agricoltura e dell’informatica. Il primo Protocollo esecutivo dell’accordo è stato firmato a Tallinn il 5 gennaio 2005 ha riguardato il periodo 2005-2008.
Il nuovo Programma Esecutivo di cooperazione nei settori della cultura e dell’istruzione tra il Governo della Repubblica Italiana e il Governo della Repubblica di Estonia per gli anni 2022-2026 è stato firmato a Tallinn il 29 agosto 2022.